Microbiologia e virologia

Patologie trattate

Il laboratorio di Microbiologia clinica fornisce un supporto valido e insostituibile alla diagnostica clinica delle patologie infettive attraverso la condivisione con gli specialisti dell’azienda e del territorio di percorsi clinico-diagnostici e terapeutici volti a criteri di appropriatezza e standard clinico professionali. Tutto il lavoro è finalizzato al raggiungimento dell’obiettivo primario della “Clinical Governance”, che è quello di favorire lo sviluppo dell’eccellenza nell’assistenza sanitaria.

I processi del laboratorio di Microbiologia sono sostanzialmente riconducibili ad un insieme di attività, che, partendo dal prelievo di materiali biologici, attraverso un’articolata processazione analitica e interpretativa, arriva alla produzione di un referto validato e firmato. 
La Struttura esegue esami di laboratorio urgenti e di routine inerenti i seguenti campi di attività:

• Batteriologia 
• Micobatteriologia 
• Micologia e Parassitologia
• Sierologia e Virologia 
• Biologia Molecolare 
• Sequenziamento NGS
• Epidemiologia 
• Controlli ambientali

Le principali metodiche utilizzate:

• Identificazione batterica con sistemi automatizzati e con spettrometria di massa Maldi-tof,conta batterica, colorazione di Gram.
• Antibiogramma (manuale e con sistemi automatizzati) Determinazione Minima Concentrazione Inibente -MIC (Linee Guida EUCAST) mediante E-test e mediante pannelli estesa in  micro- diluizione in brodo.
• Metodi per la conferma fenotipica e genotipica di produzione di ESβL (Beta Lattamasi a Spettro Esteso), AmpC (cefalosporinasi di Classe C),       carbapenemasi (Classe A, B, D) in Enterobatteri e batteri Gram-negativi non fermentanti.
• Multiplex PCR, real-time PCR.
• Sierologia in chemiluminescenza
• Test IGRA automatizzati
• Sequenziamento NGS 

Servizi erogati

I prelievi per pazienti ambulatoriali di età adulta sono effettuati presso il Poliambulatorio “Gardella” al piano terra, tutti i giorni dal lunedì al venerdì. In questa stessa sede è attiva la consegna di materiali biologici quali urine, feci, etc. È possibile prenotare il giorno e l’ora dell’appuntamento per prelievo o consegna campioni attraverso il servizio ZeroCoda oppure si può accedere senza prenotazione (per gli orari consultare la sezione Visite Ambulatoriali).

All’interno dell’Ospedale Civile è presente una sala prelievi adiacente alla Segreteria del Laboratorio, presso il Poliambulatorio Santa Caterina, dove tutti i giorni dal lunedì al venerdì dalle ore 8.00 alle 11.00 si effettuano:

• prelievi particolari
• prelievi in libera professione (utenti paganti)

I prelievi per i pazienti ambulatoriali pediatrici sono effettuati presso il Presidio Infantile al Poliambulatorio di Pediatria sito al piano terra, dal lunedì al venerdì, dalle ore 8.00 alle 10.00. In questa stessa sede avviene anche la consegna di materiali biologici quali urine e feci.
Gli esami per i pazienti interni sono prenotati direttamente nei reparti: è possibile la consultazione a video in tempo reale dei dati già validati dal Laboratorio.

Si eseguono le analisi specialistiche per i Presidi Ospedalieri dell’ASL-AL e dell’ASL-AT. Tramite una rete informatica (Laboratorio Unico Virtuale) esistente tra i Laboratori di ASL-AL e ASL-AT e la struttura di Laboratorio dell’Ospedale Civile, i dati vengono trasferiti in tempo reale alla struttura inviante sotto forma di referto firmato digitalmente.

I referti dei pazienti ambulatoriali firmati digitalmente sono scaricabili, dagli utenti che ne fanno richiesta al momento del prelievo, nel Fascicolo Sanitario Elettronico oppure sono ritirabili presso il Poliambulatorio Gardella tutti i giorni dal lunedì al venerdì, dalle ore 13.00 alle 15.55.

Attività didattiche e di ricerca

• collaborazione con l’Università Piemonte Orientale per tirocinio studenti della facoltà di Medicina e Chirurgia 
• collaborazione con il laboratorio di Farmacologia clinica e di farmacogenetica dell’ ASL TO2 per l’utilizzo di campioni biologici per la validazione di diagnostici in vitro
• titolarietà del corso di “Tecniche Microbiologiche” presso l’UPO, Corso di Laurea Magistrale in Biologia
• tutoraggio degli studenti della facoltà di Biologia con l’Università Piemonte Orientale (triennale e magistrale) e con l’Università di Pavia (magistrale) per tirocinio e supporto alla stesura della tesi di laurea
• collaborazione alla revisione di Percorsi Diagnostico Terapeutici Assistenziali (PDTA) aziendali e partecipazione a Gruppi di lavoro Regionali ( GLICA) 
• attività di ricerca su tematiche di rilevanza nazionale quale antibiotico-resistenza
• partecipazione al programma di sorveglianza nazionale sulle antibiotico-resistenze AR-ISS
• collaborazione con l’Università del Piemonte Orientale, Dipartimento di Scienze ed Innovazione Tecnologica (DiSIT) e con l’Infrastruttura Ricerca Formazione e Innovazione dell’Azienda Ospedaliera per progetti di ricerca su tematiche innovative relative al sequenziamento di acidi nucleici di singoli microrganismi e di popolazioni microbiche mediante tecnologie NGS.
• centro autorizzato alla partecipazione al Programma Nazionale sul Trapianto di Microbiota Fecale umano (FMT) della rete nazionale coordinata dal Centro Nazionale Trapianti ( CNT)

Inoltre con deliberazione del Direttore Generale ASO AL nr. 482 del 9/9/2021 e’ stato approvato il progetto “Sequencing” che prevede la creazione del Centro Unificato di Sequenziamento  ( CUS) tra il DISIT e l’Azienda Ospedaliera.

L’attività diagnostica del CUS riguarda :

•  Analisi del Microbiota Intestinale
• Lo studio delle resistenze batteriche
• Analisi  micobatteri

Aree di eccellenza

• Centro di riferimento per lo studio delle antibiotico-resistenze, per la formazione degli operatori sanitari e per i programmi di sorveglianza epidemiologica nazionali ed europei.
• Tipizzazione: caratterizzazione di microrganismi MDR, XDR e PDR di maggiore impatto clinico, causa di infezioni nosocomiali (e/o comunitarie) ed eventi epidemici
• Percorso diagnostico e terapeutico del paziente con sepsi 
• Antimicrobial e Diagnostic stewardship
• Controlli ambientali 
• Microbiota intestinale e Trapianto di microbiota ( FMT)
• Sequenziamento NGS